BIOLOGIELa bio-informatique

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La bio-informatique est une application des techniques informatiques au traitement massif de données biologiques. Elle est spécialement utilisée pour l'analyse des séquences génomiques et des protéines. Le terme de bio-informatique est apparu en 1995 dans des publications scientifiques et des programmes de recherche, avec les premiers pas de la génomique. Cette discipline prend en effet appui sur l'utilisation exhaustive des ordinateurs pour traiter la masse d'informations issue de la détermination de la séquence des génomes.

Définition et enjeux de la discipline

La bio-informatique est une discipline émergente de la recherche qui se place à l'interface de la biologie et de l'informatique. Il y a différentes fa?ons de la définir. Il est possible de classer les bio-informaticiens qui la pratiquent en trois groupes (Victor Jongeneel, 2000). Les premiers se définissent comme pratiquant une branche fondamentale de la biologie capable de prédire, par des moyens informatiques, les lois ou les comportements biologiques. Par opposition aux classiques manipulations in vivo ou in vitro pratiquées en laboratoire, on parlera alors d'expériences ??in silico?? (néologisme d'allure semi-latine, formé à partir de l'anglais silicon). Les partisans de cette définition entendent exercer une bio-informatique théorique semblable à ce que les Anglo-Saxons nomment Computational Biology, c'est-à-dire la fabrication de modèles par le calcul à partir de données biologiques disponibles (Jean-Michel Claverie, 2000). à l'opposé, un grand nombre de biologistes complètent leurs travaux en laboratoire par des analyses sur ordinateur. Ces bio-informaticiens-là ne créent pas de programmes, mais utilisent ceux qui sont écrits par d'autres, soit sur leurs ordinateurs personnels, soit sur des serveurs publics maintenus par des équipes pluridisciplinaires (Philippe Dessen, 1995). Ce domaine de l'analyse de données biologiques par ordinateur a de plus en plus tendance à se dénommer ??bioanalyse??. Entre ces deux extrêmes, il existe des coopérations entre les bi [...]


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Bioinformatique : assemblage de fragments d'ADN

Bioinformatique : assemblage de fragments d'ADN
Crédits?: Encyclop?dia Universalis France

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Bioinformatique : analyse d'une séquence d'ADN

Bioinformatique : analyse d'une séquence d'ADN
Crédits?: Encyclop?dia Universalis France

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Bioinformatique : annotation d'une séquence d'ADN

Bioinformatique : annotation d'une séquence d'ADN
Crédits?: Encyclop?dia Universalis France

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écrit par :

  • : chef du groupe logiciels et banques de données, Institut Pasteur

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Pour citer l’article

Bernard?CAUDRON, ??BIOLOGIE - La bio-informatique??, Encyclop?dia Universalis [en ligne], consulté le 23 novembre 2020. URL?: http://www.bonoaldea.com/encyclopedie/biologie-la-bio-informatique/

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